作为新型饲料添加剂，微生态添加剂与抗生素相比，具有很大的优势，代表了饲料添加剂的未来方向。

饲料中抗生素长期应用之后易产生抗药性，应用效果下降。这种结果不仅危害动物养殖过程，更为严重的后果是可能使人的抗菌药失去杀菌效果，人的感染性疾病将面临无药可治的困境。而微生态添加剂中的益生菌由于来源于动物本身，不会产生抗药性。

抗生素长期应用会产生药物残留，近而危害人的身体健康。而微生态添加剂是天然绿色产品，来源于自然，用于动物生产，不会产生污染和药物残留。

应用微生态添加剂能显著提升饲料消化率，减少有害气体产生，提升动物饲养的圈舍环境和养殖场周围环境质量。

应用微生态添加剂能显著提升动物肠壁厚度，强健肠道机能；相反抗生素使肠壁变得薄弱，进而影响动物的健康。

长期应用抗生素会损害动物的免疫器官，使动物的免疫力下降。而添加微生态制剂能够促进动物免疫器官的发育，提高动物的免疫力。

近几年来，全世界范围已就在饲料中逐步取消抗生素添加剂达成了共识，可用于添加剂的抗生素种类越来越少。用微生态添加剂替代抗生素是大势所趋。